Las Cuentas Nacionales de Gastos en Salud tienen como objetivo fundamental el proporcionar una radiografía o visión general sobre el origen de los fondos, esto es las fuentes, el destino o uso detallado de los recursos y los canales de flujo de los fondos utilizados en el sector salud.

Un poderoso instrumento como éste permite el ma nejo, distribución y movilización de los recursos del sector salud a partir de:

1. Tener una idea completa de la estructura y funcionamiento del financiamiento del sector salud ecuatoriano.
2. Realizar una toma de decisiones adecuada, basada en el conocimiento de la realidad del sector pues mejora la capacidad de los decisores en la identificación de problemas y oportunidades para cambio en el sector salud y consiguientemente para el desarrollo y monitoreo de estrategias de reforma.
3. Conocer la incidencia e importancia real de lo que implica la salud a nivel nacional en términos del Producto Interno Bruto ecuatoriano y otras variables macros.
4. Tener una idea de la magnitud de flujos y el movimiento detallado a niveles que nunca antes se los ha tenido.
5. Conocer con exactitud los subsectores y niveles del sector salud que deben ser atendidos de manera prioritaria.
6. Realizar comparaciones y conocer los niveles regionales que se gastan en salud en base de una misma metodología.